萩中小の自慢の一つに自然園があります。校舎の東南にあり約３００㎡の広さの敷地の中央にひょうたんの形をした大きな池があります。池には全長３０㎝コイが数匹泳ぎ、春には蛙の卵が見られます。樹齢５０年ほどの杉の木、シイの木やコナラ等が池の周りに点在し、下草にはハルジオン、タンポポなど多くの野草が生い茂っています。季節によって、カルガモやオナガ、渡り鳥のジョウビタキなどの野鳥も立ち寄ります。